《氮肥行业“十二五”发展思路》指出，氮肥行业将把技术进步和创新作为加快转变发展方式的重要支撑；把保障农业用肥作为加快转变发展方式的根本落脚点；把节能环保作为加快转变发展方式的重要着力点，促进氮肥工业可持续发展。
在产能调整方面，以满足“十二五”期间国内农业和工业的需求为基本目标。根据对工、农业需求的预测，2015年需要氮肥产量为4330万t，需要产能为4800万t。2010年氮肥产能为4700万t,“十二五”期间淘汰700万t落后的、竞争力差的产能，以800万t新增优势产能替代，即净增产能控制在100万t左右，到2015年全国氮肥产能方可控制在4800万t左右（折100%纯氮，下同），基本达到产需平衡的目标。
在严格控制氮肥总量方面，一是要加大淘汰落后产能的力度，引导落后的企业转产或关闭，压缩和疏导过剩产能，实现700万t氮肥落后、竞争力弱的产能平稳退出，其中包括退出290万t碳铵产能和退出410万t尿素产能；二是要严格市场准入，加强新建项目的审批管理，提高新建项目的准入门槛，严禁盲目建设，对合成氨实施产能置换方式，控制产能过快增长。
在积极推进氮肥行业技术进步方面，2015年全国氮肥行业技术和装备水平应有明显提高。全国合成氨综合能耗平均值应达到以下要求：以无烟块煤为原料的吨合成氨综合能耗降到1350 kg标煤以下；以非无烟煤为原料的吨合成氨综合能耗降到1650 kg标煤以下；以天然气、焦炉气为原料的吨合成氨综合能耗降到1150 kg标煤以下。“十二五”期间，氮肥行业废水排放总量应比“十一五”末减少17%，氨氮减少18%，化学需氧量减少13%；废气、废固基本达到综合利用和无害化处理的要求。
在企业兼并重组、提高产业集中度方面，“十二五”期间大型氮肥企业产能比重应占80%以上；全国氮肥企业数量应降至250家以下；建成20个具有核心竞争力的大型氮肥企业集团。氮肥行业要坚持市场化运作，以资产、资源、品牌和市场为纽带实施跨地区、跨行业兼并重组，提高产业集中度：一是推动优势企业实施跨地区的强强联合兼并重组，提高产业集中度；二是推动氮肥企业与能源企业、农资流通企业的联合或兼并重组，整合生产要素，实现优势互补，形成大型化和集约化的企业集团，提高企业竞争力。
在优化产品结构方面，2015年，尿素产能比重维持在64.5%；碳铵产能下降一半，比重下降至6%；硝酸铵产量随硝基复合肥的增长有较大增加，比重提升为7.3%；氯化铵随着联碱的发展，产能略有增加，占氮肥总产能的7.7%；硫酸铵因环保和综合利用，比重增为4.4%。2015年，复合（混）肥及缓控肥的比重增加至45%左右，氮肥的复合率比“十一五”末期提高50%以上。“十二五”期间，氮肥行业要狠抓多层次、多产品开发，有效疏导过剩产能，提高经济效益。一是提高大颗粒尿素、缓控释肥、专用肥和硝基复合肥的比重；二是做好并拓展农化服务，参与测土配方施肥工程，生产复合肥、掺混肥、配方肥，减少生产及流通环节，降低产品成本；三是肥化并举，建立多层次、多产品的化工生产体系，延伸产品链，提高附加值，提高企业经济效益和竞争力。
此外，“十二五”期间，全国以非无烟煤为原料的合成氨产能比重由现在的10%提高到25%，以无烟煤为原料的合成氨产能比重由现在的65%下降至55%；以天然气为原料的合成氨产能比重下降至18%；其余2%为以焦炉气为原料。